抖音小店保证金的退还流程如下：
- 验证身份：首先，商家需要进入店铺管理页面，找到“退店”选项，核对店铺信息，包括资质类型、店铺名称、店铺ID、公司名称、经营者/法定代表人名称等。如有缺失或错误信息，可在店铺基本信息中进行更新和补充。
- 申请退店：满足以下条件后，方可申请退店：店铺内所有商品已下架，确保不再发生新的交易；在店铺首页显着位置持续公示已满30天；所有商品订单为交易完成或者交易关闭状态，且后一笔订单完成已满90天；无佣金欠款；周期打款已结清；无保证金欠款。
- 账户审核：提交退店申请后，商家需要填写保证金退还的银行账户信息。平台将在商家提交后的3个工作日内完成审核。个体工商户商家可填写经营者个人银行账户或店铺主体对应的对公银行账户；企业商家需填写店铺主体对应的对公银行账户。
- 签署终止协议：审核通过后，商家需要点击“同意协议”，并签署《终止协议》。协议签署后，店铺将关闭。
- 退还保证金：保证金将在店铺关闭的7个工作日内退回至商家填写的银行卡账户中。如需再次开启店铺，需在店铺关闭的6个月后，用原账号登录商家后台，点击【开启店铺】。